20年来，集团基本采取以条为主、条块结合的管理模式，主要抓好预算管理、协议管理、质量管理，制度建设逐渐完善，员工队伍建设趋于成熟。
改革内部机构。为进一步加强管理，2014年6月，集团将原物流服务中心更名为物资管理部，服务职能转变为管理职能。2017年9月，为服务事业发展需要，集团将物业管理由条状管理改为块状管理，将原物业服务中心分设为仓前校区物业服务中心、下沙校区物业服务中心；根据学校校区调整，撤销古荡湾校区服务中心，玉皇山校区服务中心为美术学院提供后勤保障服务。2019年8月，为保障钱江学院在下沙校区独立办学的同时尝试校外市场开拓，成立钱江项目部，为钱江学院提供综合性后勤服务保障，终因钱江学院转设和下沙校区综合利用于2021年3月底撤销，饮食服务、公寓服务、网点监管等恢复条状管理，重新成立下沙校区物业服务中心负责下沙校区的物业服务和管理。
模拟企业化运作。努力坚持并探索内部管理模拟企业化运作，以预算为指导，以协议形式加强对二级部门的管理，明确年度经济目标责任和管理服务责任，协议与绩效考核办法基本挂钩；二级部门积极划小核算单位，也与团队、班组建立协议管理的关系，挖掘经济效益和社会效益。进一步健全和完善两级管理、薪酬分配、目标任务考核等政策，定性考核与定量考核相结合，建立起与部门服务满意度、经济运行、综合治理、内部管理、廉政建设等挂钩的综合绩效考评体系。2019年，集团人均产值超过17万元，为近十年最高。
健全规章制度。根据不同阶段的管理需要，不断修订完善后勤管理层面人、财、物制度，2002年首次印发规章制度汇编，20年间系统整理、编印规章制度7次。2005年集团将“制度规范体系”作为四大体系之一予以重点建设；2014年开始，以巡视审计整改为契机，进一步总结经验，探索创新，修订、制订了一大批制度；2017年末新增、修订并最终确定了集团新版规章制度45项；近三年内，每年根据专项审计的要求，及时通过立改废释，2018年发布规章制度28个，2019年8个，2020年12个，确保集团运行规范、有效，特别是有效地促进了集团人、财、物的统一管理。
抓好质量管理。2003年，集团首次开始实施“规范化工程”，饮食服务和住宿服务全面落实ISO9000质量体系认证，经过一年的建设，全面开展达标验收。先后实施“质量提升年”“窗口服务单位优质服务行动”等质量提升工程，巩固规范化达标验收成果。深化五常法管理，推行阳光厨房、明厨亮灶建设，集团餐厅、公寓、教育超市、获得浙江省标准化示范食堂、示范公寓、首批高校教育超市“标准店”等称号；2004年，文一路校区餐厅成为杭州市首批食品卫生A级示范餐厅；2013年12月，仓前校区学生公寓以优异成绩顺利通过省高校学生公寓标准配置评估验收；2017年被评为“学校食品安全示范食堂”。完善质量监控体系，运用智能化手段，开展线上与线下、综合与专项、定期与随机监控，进一步发挥质量监控在集团管理、服务查漏补缺上的前置作用。2020年，集团再次导入ISO9001 质量管理体系和ISO22000 食品安全管理体系，以服务标准化、规范化提高质量，提升治理能力和水平。
加强队伍建设。随着学校办学规模的扩大，20年里，集团服务保障队伍也进一步壮大，员工人数从五六百人增加到近1300人，其中2005年下半年突破千人，实行“老人老办法、新人新办法”人事管理政策，全员竞聘上岗，逐步建立以岗定薪、按绩论酬、兼顾资历的分配体系。2004年3月起实施“百名骨干”工程，决定用三年左右的时间组建一支具有较高文化素质、管理能力、服务技能的非在编骨干队伍，人数为100名左右。2007年，设立“首席员工”评选制度，出台《骨干定级管理暂行办法》，对所有员工进行定级，树立职员身份，“同工不同酬”问题得到改善，所定级别与薪酬挂钩，收入与贡献度挂钩。2009年和2011年，在学校人事处的支持下，两次为集团员工争取到进编名额，集团8名员工转为事业编制。近十年里，岗位设置数得以有效控制，建立了总经理层—部门经理层—部主任层的管理层级，分设管理服务岗、核心技术岗；实行与岗位相匹配的绩效工资制，完善“五险一金”缴纳机制，员工队伍流动率保持在合理水平；将内部培养和社会引进相结合，组织开展“骨干训练营”，设立“技术能手”“金牌师傅”“领军人才”评选制度，努力提升管理队伍和技术队伍的竞争力。